分子實驗介紹——熒光定量pcr檢測
熒光定量pcr是檢測生物樣品中rna含量的普遍的方法,通過熒光染料或熒光標(biāo)記的特-的探針,對pcr產(chǎn)物進(jìn)行標(biāo)記-,pcr引物設(shè)計,實時在線監(jiān)控反應(yīng)過程,結(jié)合相應(yīng)的軟件可以對產(chǎn)物進(jìn)行分析,計算待測樣品模板的初始濃度。目前主要使用sybr green和taqman法對rna含量進(jìn)行檢測。sybr green在低樣本量時成本較低,目前選用的較多。
sybr green i是一種只與dna雙鏈結(jié)合的熒光染料。當(dāng)它與dna雙鏈結(jié)合時,發(fā)出熒光;從dna雙鏈上釋放出來時,熒光信號急劇減弱。因此,在一個體系內(nèi),其信號強度代表了雙鏈dna分子的數(shù)量。sybr green熒光染料-量pcr的基本過程是:1、開始反應(yīng),當(dāng)sybr green染料與dna雙鏈結(jié)合時發(fā)出熒光。2、dna變性時,sybr green染料釋放出來,熒光急劇減少。3、在聚合延伸過程中,引物退火并形成pcr產(chǎn)物。4、聚合完成后,熒光定量pcr,sybr green染料與雙鏈產(chǎn)物結(jié)合,定量pcr系統(tǒng)檢測到熒光的凈增量加大。
實驗流程:細(xì)胞或組織rna提取-rna濃度檢測-rna逆轉(zhuǎn)錄-定量pcr檢測。
結(jié)果示例:
圖 a 基因擴增曲線圖;b 基因擴增溶解曲線圖;c mrna相對表達(dá)量變化
從圖中可以擴增曲線可以看出目的rna擴增效果,溶解曲線可以看出引物識別特-情況,通過使用δδct方法計算可以得到每個組中目的mrna表達(dá)變化。
分子生物學(xué)檢測服務(wù)
隨著生命科學(xué)和化學(xué)的不斷發(fā)展,pcr,人們對生物體的認(rèn)知已經(jīng)逐漸深入到微觀水平。從單個的生物體到qi官到組織到細(xì)胞,再從細(xì)胞結(jié)構(gòu)到-和蛋白的分子水平,人們意識到可以通過檢測分子水平的線性結(jié)構(gòu)如-序列,來橫向比較不同物種,同物種不同個體,同個體不同細(xì)胞或不同生理病理狀態(tài)的差異。這就為生物學(xué)和醫(yī)學(xué)的各個領(lǐng)域提供了技術(shù)平臺。分子生物學(xué)檢測技術(shù)是現(xiàn)代分子生物學(xué)與分子遺傳學(xué)取得進(jìn)步的結(jié)晶,是在人們對基因的結(jié)構(gòu)以及基因的表達(dá)和調(diào)控等生命本-題的認(rèn)識日益加深的基礎(chǔ)上產(chǎn)生的。近年來,分子生物學(xué)檢測技術(shù)的方法學(xué)研究取得了進(jìn)展,先后建立了各種分子生物學(xué)檢測技術(shù)。
emsa實驗
emsa:凝膠遷移或電泳遷移率檢測是一種檢測蛋白質(zhì)和dna序列相結(jié)合的技術(shù),初用于研究dna結(jié)合蛋白和其相關(guān)的dna結(jié)合序列相互作用,可用于定性和定量分析。分為2種類型:同位素標(biāo)記探針,實時定量pcr,非同位素標(biāo)記探針。
通常將純化的蛋白和細(xì)胞粗提液和32p同位素標(biāo)記的dna或rna探針一同保溫,在非變性的聚bing烯凝膠電泳上,分離復(fù)合物和非結(jié)合的探針。dna-復(fù)合物或rna-復(fù)合物比非結(jié)合的探針移動得慢。同位素標(biāo)記的探針依研究的結(jié)合蛋白的不同,可是雙鏈或者是單鏈。當(dāng)檢測如轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子一類的dna結(jié)合蛋白,可用純化蛋白,部分純化蛋白,或核細(xì)胞抽提液。在檢測rna結(jié)合蛋白時,依據(jù)目的rna結(jié)合蛋白的位置,可用純化或部分純化的蛋白,也可用核或胞質(zhì)細(xì)胞抽提液。競爭實驗中采用含蛋白結(jié)合序列的dna或rn片duan和gua核苷酸片段特異,和其它非相關(guān)的片段非特異,來確定dna或rna結(jié)合蛋白的特-。在競爭的特異和非特異片段的存在下,依據(jù)復(fù)合物的特點和強度來確定特異結(jié)合。
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