轉(zhuǎn)錄組測(cè)序
轉(zhuǎn)錄組即某個(gè)物種或特定細(xì)胞在某一功能狀態(tài)下產(chǎn)生的rna的總和,是研究細(xì)胞表型和功能的一個(gè)重要手段。與基因組不同的是,轉(zhuǎn)錄組的定義中包含了時(shí)間和空間的限定。同一細(xì)胞在不同的生長時(shí)期及生長環(huán)境下,其基因表達(dá)情況是不相同的。轉(zhuǎn)錄組測(cè)序rna-seq是指利用第二代高通量測(cè)序技術(shù)進(jìn)行cdna測(cè)序,快速地獲取某一物種特定qi官或組織在某一狀態(tài)下的轉(zhuǎn)錄本。相對(duì)于傳統(tǒng)芯片而言,rna-seq無需預(yù)先設(shè)計(jì)探針,即可對(duì)物種的細(xì)胞類型的轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行檢測(cè),能夠提供較的數(shù)字化信號(hào),---多少錢,更高的檢測(cè)通量以及更廣泛的檢測(cè)范圍,是目前深入研究轉(zhuǎn)錄組復(fù)雜性的---工具。
蛋白質(zhì)互作驗(yàn)證服務(wù)
在后基因組時(shí)代,基因的表達(dá)產(chǎn)物蛋白質(zhì)作為生物功能直接的執(zhí)行者和體現(xiàn)者,實(shí)時(shí)定量pcr,在生物集體的生理及病理中扮演著重要的角色。高通量的蛋白質(zhì)組學(xué)研究技術(shù)可以在上述過程中篩選出具有潛在價(jià)值的生物標(biāo)記和靶點(diǎn)。但是長期以來,-的蛋白質(zhì)表達(dá)分析譜并沒有提升我們對(duì)生物標(biāo)志物的認(rèn)識(shí),其主要原因是差異蛋白的分析結(jié)果缺乏規(guī);尿(yàn)證。
mirna測(cè)序
microrna(mirna)是一種大小約21—23個(gè)堿基的單鏈小分子rna,pcr,是由具有發(fā)夾結(jié)構(gòu)的約70-90個(gè)堿基大小的單鏈rna前體經(jīng)過dicer酶加工后生成,不同于sirna雙鏈但是和sirna密切相關(guān)。microrna通過和靶基因mrna堿基配對(duì)引導(dǎo)沉默復(fù)合體risc降解mrna或抑制mrna的翻譯,pcr引物設(shè)計(jì),從而在轉(zhuǎn)錄后水平調(diào)控蛋白表達(dá)新發(fā)現(xiàn)mirna也能在轉(zhuǎn)錄水平調(diào)控基因表達(dá)。mirna在物種進(jìn)化中相當(dāng)保守,在動(dòng)物、植物和---等中發(fā)現(xiàn)的mirna表達(dá)均有嚴(yán)格的組織特---和時(shí)序性。mirna在細(xì)胞生長和發(fā)育過程中起多種作用,包括調(diào)控發(fā)育、分化、凋亡和增殖等。
目前研究mirna的方法主要是realtime-pcr、生物芯片技術(shù)以及第二代測(cè)序技術(shù)。基于第二代測(cè)序技術(shù)的mirna測(cè)序,可以一次獲得數(shù)百萬條mirna序列,能夠快速鑒定出不同組織、不同發(fā)育階段、不同---狀態(tài)下已知和未知的mirna及其表達(dá)差異,為研究mirna對(duì)細(xì)胞進(jìn)程的作用及其生物學(xué)影響提供了有力工具。
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